
中國(guó)科學(xué)院7日在官網(wǎng)上發(fā)文披露,國(guó)家生物信息中心(CNCB)/國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心(NGDC)首批自主收錄的5株2019新型冠狀病毒基因組序列實(shí)現(xiàn)與美國(guó)NCBI核酸數(shù)據(jù)庫(kù)GenBank數(shù)據(jù)同步與共享。
全文如下:
國(guó)家生物信息中心(CNCB)/國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心(NGDC)首批自主收錄的5株2019新型冠狀病毒基因組序列實(shí)現(xiàn)與美國(guó)NCBI核酸數(shù)據(jù)庫(kù)GenBank數(shù)據(jù)同步與共享。
CNCB/NGDC建立的2019新型冠狀病毒信息庫(kù)(2019nCoVR)上線運(yùn)行以來(lái),已匯交并整合全球范圍內(nèi)產(chǎn)出的82株病毒的87條非冗余基因組序列信息,是目前收錄2019新型冠狀病毒基因組數(shù)目最多的數(shù)據(jù)庫(kù)。在中科院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心支持下,該信息庫(kù)為全球106個(gè)國(guó)家和地區(qū)的3萬(wàn)余訪客提供數(shù)據(jù)服務(wù),序列文件被下載30萬(wàn)余次。
為了進(jìn)一步擴(kuò)大2019-nCoV基因組序列應(yīng)用范圍,CNCB/NGDC與國(guó)際生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)建立了數(shù)據(jù)同步共享機(jī)制,第一批自主收錄的5個(gè)2019-nCoV全基因組序列(序列編號(hào)為GWHABKF00000000-GWHABKJ00000000)已經(jīng)在NCBI發(fā)布(序列編號(hào)為MT019529- MT019533,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MT019529,MT019530,MT019531,MT019532,MT019533)。通過(guò)共享機(jī)制,國(guó)內(nèi)研究人員只需將數(shù)據(jù)遞交一次,即可實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)在CNBC/NGDC和NCBI同時(shí)發(fā)布。
CNCB/NGDC將繼續(xù)推動(dòng)數(shù)據(jù)共享,為廣大科研人員開(kāi)展對(duì)新型冠狀病毒的深入研究與疫情防控提供方便快捷的數(shù)據(jù)支撐。
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